L’intervention se fait sous anesthésie locale. Une incision est alors tracée autour de la dent infectée. La gencive est décollée afin de laisser apparaître le foyer infectieux et l’extrémité de la racine. Les deux ou trois derniers millimètres de la racine sont enlevés ainsi que l’os infecté autour de la racine à l’aide d’une fraise. L’orifice du canal de la racine sera agrandi puis obturé à rétro, avec un matériau qui le rendra étanche. Un comblement osseux et une membrane peuvent être nécessaires pour aider l'os à se régénérer, puis des sutures sont réalisées pour refermer le site opératoire. Les sutures seront retirées à 8 jours.
L’œdème post-opératoire disparaît en une semaine. L’os sera complètement reformé en un à trois ans suivant le volume du défaut osseux.